Перу займає величезну територію і тому основним видом транспорту є літак. Переліт Ліма - Куско займає 55 хвилин. Залізниця зв'язує Священну Долину інків, Куско, Мачу-Пікчу з озером Тітікака, а також Арекіпу з Тітікака. Потяг з Куско в Пуно (озеро Тітікака) йде близько 10 годин. Досить популярно автобусне сполучення. Автобуси комфортабельні, але переїзди дуже тривалі. Наприклад, автобус Ліма - Пуно йде близько 42 годин. Невеликий нюанс: у Перу часто не дотримується розклад руху всіх видів транспорту, тому пересадки на літак, планування поїздок по залізниці і т.д. слід робити з запасом по часу.